全自動均質器的分散過程是基于轉子與定子的切割原理。該實驗設備是由高速電機驅動分散均質工作頭，促使轉子作高速的圓周遠動。高速旋轉的轉子與配合精密爪式結構的定子之間形成高頻、強烈的圓周切線速度、角向速度等綜合動能，促使實驗物料從實驗容器底部吸入轉子區，并在巨大的離心力作用下從定子孔中甩出。定、轉子在合理狹窄的間隙中形成強烈、往復的液力剪切、摩擦、離心擠壓、液流碰撞等綜合效應。實驗物料在容器中循環往復以上工作過程，并承受每分鐘高達數萬次的剪切、撕裂、撞擊和混合，從而達到分散均質效果，其效能比普通的攪拌高約一千倍。
全自動均質器注意事項
1、使用前先將電源插頭固定牢靠后，再打開機器開關。插頭不能使其出現松動，因為機器工作時會產生振動導致插頭脫落。這種突然短點對機器會造成損傷。
2、均質器工作時不準隨便打開均質器門，防止樣液飛濺(有的均質器打開門以后自動停止拍擊均質)，一定要先關機器再開門，然后同樣關閉門之后再開機。
3、使用均質器之前，一定要檢查均質器內是否有異物，防止損傷機械裝置或均質袋。
4、堅硬樣品，盡量不要用全自動均質器，防止均質袋破裂，冷凍樣品需緩化解凍以后才能使用拍擊式均質器。當一定要拍打堅硬樣品時，加套均質袋。
5、均質器的底部是空的，如遇均質袋意外破裂時，方便清理溢出物。
6、全自動均質器和均質袋放置在陰涼干燥處，特別是均質袋應避酸堿、避陽光，防止其過早的變脆老化。
7、均質器用完之后，先關機斷電，然后將其內外清理干凈。
8、對于一些拍打均質后，容易堵塞移液管或移液器槍頭的樣品，建議使用帶過濾網的無菌均質袋。
